兰州大学医学院现拥有10个省级重点实验室(甘肃省胃肠病重点实验室、甘肃省消化系肿瘤重点实验室、甘肃省骨关节疾病研究重点实验室、甘肃省泌尿系统疾病研究重点实验室、甘肃省新药临床前研究重点实验室、甘肃省血液病重点实验室、甘肃省生物治疗与再生医学转化重点实验室、甘肃省循证医学与临床转化重点实验室(培育)、甘肃省心血管疾病重点实验室(培育)、甘肃省生殖医学与胚胎重点实验室(培育))，16个省级医疗质量控制中心、23个省级医疗卫生重点学科，30余个各类国家级培训基地。
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兰州大学医学院作为兰州大学医学事务统筹、协调、管理的管理机构，下设综合办公室、组织人事部、教育教学部三个处级机构。学院的科研成果丰硕，共获国家奖项10余项，省部级奖项百余项，发表论文数万篇，授权专利数百项。其中，近三年，连续获得甘肃省科技进步一等奖，发表SCI论文、影响因子、国家自然基金项目数量逐年翻番。学院的整体实力在西北乃至全国具有重要的影响力。
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兰州大学医学院下设的3所直属附属医院中，第一医院和第二医院均为三级甲等医院，开放床位数3招生9张，口腔医院开放口腔综合治疗椅位70张。2013年，各附属医院门急诊人次达210万，出院人次达13.3万，住院手术台次达4.8万。药学院与甘肃省较大规模的兰州大学第一附属医院、兰州大学第二附属医院、甘肃省人民医院、三爱堂医院、兰州空军总医院、铁路中心医院、兰州陆军总院等机构建立了长期的教学协作关系，拥有相对稳定的药学见习与实习基地。近年来，学生就业率较高。
