三江学院的校名来历可追溯至1902年的三江师范学堂（东南大学、南京大学等高校的前身）。1992年3月,东南大学陶永德、戚焕林,南京大学丁承憼,南京职工大学谢明才四位退休和即将退休的教授、教育管理工作干部发起并创办三江大学，19招生年6月江苏省政府同意三江大学筹建并试招生，1995年4月由原国家教委批准正式建校，1999年学校定址于雨花台区铁心桥，2002年2月经国家教育部批准升格为本科高校，定名为三江学院。2006年5月通过江苏省学士学位授予权评审。2007年5月我校作为全国首家民办本科高校接受了教育部普通高等学校本科教学工作水平评估，2008年3月以良好的成绩通过教育部普通高等学校本科教学工作水平评估。
学校在创建时确立了董事会领导下的校长负责制的领导和管理体制。原南京工学院院长钱钟韩教授出任首任董事长，著名美籍华裔社会活动家、美国国际合作委员会主席陈香梅女士任名誉董事长，原南京大学校长匡亚明教授出任名誉校长，并亲笔题写了“唯实求真、开拓创新”的校训，东南大学陶永德教授担任首任校长。2003年根据《民办教育促进法》精神，学校在原董事会基础上改组成立理事会，由第九届全国人大代表、原江苏省教委主任、东南大学党委书记陈万年教授任理事长、校长、党委书记。2013年3月，经江苏省委教育工委委派，原江苏省委教育工委副书记丛懋林同志任三江学院党委书记。2014年1月，经三江学院理事会投票决定，原副校长陈云棠教授任三江学院校长。2017年5月，经三江学院理事会投票决定，原常务副校长笪佐领教授任三江学院校长。
钱钟韩教授在学校创建时曾挥毫写道：“弦歌不绝、学海无涯、泽被三江、志兴中华”，可谓是“三江传人办三江”，为实现高等教育大众化，为实现中华民族的伟大复兴，三江传人肩负着历史的重任。在25年的办学历程中，三江学院弘扬三江师范学堂“俭朴、勤奋、诚笃”的优良传统，坚持“立德树人、以生为本、学用结合、服务社会”的办学方针，以“唯实求真，开拓创新”为校训，以“严谨、勤奋、自强、和谐”为校风。 2011年我校成为江苏省高等教育综合改革实验区“建立现代大学制度”项目的试点高校。我校全面推进二级学院和职能部门目标管理责任制，明确人才培养责任，增强办学自主权，建立主要教学环节质量标准，健全学校、学院两级质量保障体系。通过管理创新和制度创新，不断提高办学质量，努力创建特色鲜明的高水平应用型大学。
学校现有铁心桥主校区、东校区、南校区、东山校区、竹山路校区。铁心桥主校区座落于南京城南雨花台区牛首山麓新秦淮河畔，位于二水三山之间，“南望牛首，东望方山，北望紫金”“大江雄浑，秦淮澄清”（均选自原中央大学校长罗家伦创作的《忆江南》一诗），欧式校舍，典雅壮丽，与青山绿水融为一体，绿化率达70%。校舍面积42万平方米，千兆光纤校园网覆盖整个校园，图书馆藏书329万多册。
现有全日制本科在校生20472人，设有14个二级学院、49个本科专业，涵盖了文、工、经、管、理、艺、法等学科门类，建立了以文、工、经、管、理、艺、法等学科为主，多学科协调发展的专业体系，形成了普通本科教育、职业技术教育、成人教育和中外合作教育等多类型、多层次的办学格局。学校还先后成立了知识产权研究所、高等教育研究所、旅游资源开发研究所、市场营销战略研究所、艺术设计研究所、自动化研究所、东亚文化研究中心、土木工程技术研究所、高级职业经理MBA培训研究中心、历史与文化地图研究院等研究机构。江苏省鲁迅研究会、江苏省网络文学院设立在我校。
学校坚持人才强校战略，充分利用“名校强市”的资源优势和民办机制，实施“积极引进、着力培养、择优聘用、逐步优化”的建设方针。截至2017年底，学校共有专兼职教师1037名，其中具有高级职称的教师占教师总数的46%，具有硕士以上学位的中青年教师占教师总数的74.7%。此外，学校还柔性聘请了一批国内相关学科和专业的学者、知名人士担任教授或客座教授。逐步建成了一支以专任教师为主体，以驻宁高校教授、行业（企业）专家、外籍教师为补充的多元化、优质师资队伍，较好地满足了应用型人才培养的需要。
